Utdanningsfaglig CV Alexander (Lex) Nederbragt
Utdanning
- 1997-2001 PhD Biologi, Utrecht Graduate School of Developmental Biology, Universitetet i Utrecht, Nederland
- 1990-1996 BSc & MSc Biologi, Universitetet i Utrecht, Nederland
Arbeidserfaring
- 2018- Førstelektor, Inst. for Biovitenskap og Inst. for Informatikk, Universitetet i Oslo
- 2018- Nestleder med hovedansvar for koordinering av utdanningsaktiviteter, Senter for Bioinformatikk, Inst. for Informatikk, Universitetet i Oslo
- 2013-2018 Førsteamanuensis II (20%), Inst. for Informatikk, Universitetet i Oslo
- 2015-2018 Senior ingeniør (fast), Inst. for Biovitenskap, Universitetet i Oslo
- 2005-2018 Postdoktor, forsker, Senior ingeniør, Inst. for Biovitenskap, Universitetet i Oslo
- 2003-2005 Senior Scientist, Lingvitae AS, Oslo
- 2002-2003 Postdoktor, University of Hawaii, USA
Universitetspedagogisk kompetanse
- Jeg tok Felles innføringsdel i 2014 som 20% 1. amanuensis II
- Jeg fullførte Felles innføringsdel for Universitetspedagogisk Basiskompetanse i 2019
- Moduler tatt i tillegg til Fellesdelen:
- Forskningsveiledning (2014)
- Forelesning og undervisning - det dramaturgiske aspekt (2015)
- Pedagogisk mappe (2020)
- Læring og undervisning med universell utforming (2022)
Emneansvar
- BIOS1100 2017-
- Kurstittel: Innføring i beregningsmodeller for biovitenskap
- Emnesidene: https://www.uio.no/studier/emner/matnat/ibv/BIOS1100
- INF-BIO5121/9121 2012-2016
- Kurstittel: High Throughput Sequencing technologies and bioinformatics analysis
- Emnesidene: https://www.uio.no/studier/emner/matnat/ifi/INF-BIO5120/index-eng.html
- Kurssidene for høsten 2016: http://inf-biox121.readthedocs.org/en/2016
Annen universitetsundervisning
- MNPED9000 Teaching in STEM 2022-
- Tema: Formative assessment
- Tema: Cognitive load and learning environment
- BIOS-IN5410 Bioinformatics for Molecular Biology 2021-
- Tema: Reproducible Bioinformatic Analyses
- MBV3070/BIOS3010 Bioinformatikk 2019-
- Tema: Python programmering
- Tema: Genome assembly and annotation
- MBV-INF4410/9410 Bioinformatics for Molecular Biology 2013-2016
- Forelesning “The bioinformatics of sequencing and assembling genomes”
- Forelesning “What does it mean to do bioinformatics?”
- BIO9905MERG1 - Bioinformatics for Metagenomic Analyses and Environmental Sequencing (2011)
- Forelesning “Next Generation Sequencing techniques and data relevant for metagenomics analyses”
- Forelesning “Assembly of metagenomes”
- BIO2120 Evolusjonsbiologi 2006-2007
- Forelesning “Evolution and Development”
- Forelesning “Evolution of Genes and Genomes”
- Oppgaver for gruppearbeid
- Erasmus ICP course Marine Cell Biology (Observatoire Oceanologique, Banyuls-sur-mer, France) 2000
- Forelesning “Fundamental aspects of development”
- Forelesning “Cell cycle changes during development”
Workshops
- Forskerskole i Bioinformatikk NORBIS Summer School “Robust and reproducible practices in bioinformatics programming” 2018
- Next-Gen Sequence Analysis Workshop ‘week 3’ (intermediate and advanced skills) (invitert), Michigan State University 2015
- University of California Davis Assembly Masterclass (invitert) 2013
- Norwegian Sequencing Centre course: High Through-put Sequencing: technology basics, applications and bioinformatic analysis 2011
- Websidene
- Jeg gjennomførte en Workshop om Genome Assembly
- De novo genome assembly (invitert), Univ. of Gothenburg, 2011
Utdanningsfaglige utviklingsprosjekter
- Prosjekt “Integrasjon av Jupyter og Canvas for digital vurdering”
- Utlysning av prosjektmidler for digital vurdering
- Prosjektsiden (krever login med UiO brukernavn og passord)
Lederroller
- Leder, Prosjekt Digitalt Læringsmiljø 2030 (2023)
- Styreleder, Carpentry@UiO (2019-)
- Nestleder med ansvar for utdanning i Bioinformatikk, Senter for Bioinformatikk (2018-)
- Medlem av ledergruppe Centre for Computing in Science Education (CCSE, et SFU ved UiO) (2017-)
- Medlem Fagråd for IT i Utdanning (2022-)
- Leder for Styret Forskerskole Digitalt Liv Norge (2016-2020)
- Medlem, så leder, Executive Council (styret) for The Carpentries (2018-2021)
Relevante vitenskapelige publikasjoner
- A. Nederbragt, R. M. Harris, A. P. Hill and G. Wilson (2020). “Ten quick tips for teaching with participatory live coding”, PLOS Computational Biology, 16(9),pp. e1008090, doi: 10.1371/journal.pcbi.1008090
Vedlegg
Se pedagogisk mappe, under “Vedlegg for Utdanningsfaglig CV”.