7. Dokumentasjon

Universitetspedagogisk kompetanse

  • Jeg tok Felles innføringsdel for Universitetspedagogisk Basiskompetanse i 2019

    • Kursbevis: Fil: Kursbevis_universitetspedagogisk_basiskompetanse.pdf

    • Utviklingsnotat: Fil: Utviklingsnotat_Fellesdelen_2019.pdf

  • moduler tatt i tillegg til Fellesdelen:

    • Forskningsveiledning (2014)

      • Utviklingsarbeid: Fil: Utviklingsarbeid_Forskningsveiledning_2014.pdf

    • Forelesning og undervisning - det dramaturgiske aspekt (2015)

    • Pedagogisk mappe (2020)

  • Jeg tok Felles innføringsdel i 2014 som 20% 1. amanuensis II

    • Utviklingsarbeid: Fil: Utviklingsarbeid_Fellesdelen_2014.pdf

En klar utvikling over tid

Emneansvar

Annen universitetsundervisning

  • MBV-INF4410/9410 Bioinformatics for Molecular Biology 2013-2016

    • Forelesning “The bioinformatics of sequencing and assembling genomes”

    • Forelesning “What does it mean to do bioinformatics?”

  • BIO9905MERG1 - Bioinformatics for Metagenomic Analyses and Environmental Sequencing (2011)

    • Forelesning “Next Generation Sequencing techniques and data relevant for metagenomics analyses”

    • Forelesning “Assembly of metagenomes”

  • BIO2120 Evolusjonsbiologi 2006-2007

    • Forelesning “Evolution and Development”

    • Forelesning “Evolution of Genes and Genomes”

    • Oppgaver for gruppearbeid

Workshops

  • Next-Gen Sequence Analysis Workshop ‘week 3’ (intermediate and advanced skills) (invitert), Michigan State University 2015

  • University of California Davis Assembly Masterclass (invitert) 2013

  • Norwegian Sequencing Centre course: High Through-put Sequencing: technology basics, applications and bioinformatic analysis 2011

  • De novo genome assembly (invitert), Univ. of Gothenburg, 2011

  • Erasmus ICP course Marine Cell Biology (Observatoire Oceanologique, Banyuls-sur-mer, France) 2000

    • Forelesning “Fundamental aspects of development”

    • Forelesning “Cell cycle changes during development”

Software Carpentry, Data Carpentry, The Carpentries, Carpentry@UiO

  • Software Carpentry

  • Data Carpentry

  • fra og med 2018 ble disse sammen til The Carpentries

  • jeg er en sertifisert instruktør og instruktør trener

    • Fil: SoftwareCarpentry_Instructor_Certificate.pdf

    • Fil: DataCarpentry_Instructor_Certificate.pdf

    • Fil: Carpentries_Instructor_Trainer_Certificate.pdf

  • Jeg har bidratt til undervisningsmaterial til The Carpentries

    • The Carpentries Instructor Training [13]

    • Software Carpentry: The Unix Shell [21]

    • Software Carpentry: Programming with Python [22]

    • Software Carpentry: Version Control with Git [23]

    • Software Carpentry: Automation and Make [24]

    • Data Carpentry Wrangling Genomics Lesson [25]

  • Jeg er også medlem av The Carpentries Executive Council, som kan sees på som organisajsonens styret (2018-2021)

  • Carpentry@UiO

    • Sammen med Karin Lagesen og Realfagsbiblioteket etablerte vi i 2014

    Carpentry@UiO

  • Software Carpentry workshops jeg har bidratt til

    • Universitetet i Oslo: 2012, 2013, 2015 - 2019

    • Netherlands eScience Centre: 2017

    • Universitet i Bergen: 2014

    • Science for Life Laboratory, Stockholm, Sverige: 2014

    • Online (ved UiO): 2020, 2021

  • Instruktør trening workshops jeg har undervist for

    • Universitetet i Oslo: 2016, 2018

    • Online for the Carpentries: 2016-2019

En forskende tilnærming

  • Vitenskapelige publikasjoner

    • A. Nederbragt, R. M. Harris, A. P. Hill and G. Wilson (2020). “Ten quick tips for teaching with participatory live coding”, PLOS Computational Biology, 16(9),pp. e1008090, doi: 10.1371/journal.pcbi.1008090

  • Konferansebidrag

    • MNT konferansen mars 2019: Gregers, T.F., and Nederbragt, Lex (2019). Lektorstudenter utvikler unik kompetanse og bidrar til økt kvalitet på begynneremner gjennom en undervisningsrettet master. Nordic Journal of STEM education 3, 23–27, https://doi.org/10.5324/njsteme.v3i1.2992. Tilgjengelig som fil: Gregers and Nederbragt, Lex - 2019 - Lektorstudenter utvikler unik kompetanse og bidrar.pdf

    • MNT konferansen mars 2021: J.E.Eliassen, M.V.Bøe, L.Nederbragt, M.M.Berg, og T.F.Gregers (2021). Motivasjon for beregningsorientert biologi og sammenhengen med matematikk R2 fra videregående opplæring. Nordic Journal of STEM education, in press. Tilgjengelig som fil: Eliassen_etal_2021_Motivasjon for beregningsorientert biologi.pdf

  • Forskning på egen undervisning

    • Masterstudent June Edvarda Eliassen (2020)

      • Tittel: Biologistudenters motivasjon for beregningsorientert biologi etter innføring av krav om full fordypning i realfaglig matematikk

      • Lenke til oppgaven: http://urn.nb.no/URN:NBN:no-82918

      • Fil: Masteroppgave_Eliassen.pdf

    • Masterstudent Sofie Rudberg (2020)

      • Tittel: Relevansen av kompetansen fra matematikk R2 i beregningsorientert biologi

      • Lenke til oppgaven: http://urn.nb.no/URN:NBN:no-82936

      • Fil: Masteroppgave_Rudberg.pdf

    • Masterstudent Marthe Mjøen Berg (2019)

      • Tittel: Studentar si interesse og meistringsforventning for programmering og modellering i biologi

      • Lenke til oppgaven: http://urn.nb.no/URN:NBN:no-73633

      • Fil: Masteroppgave_Berg.pdf

    • Masterstudent Lars Erik Håland (2019)

      • Tittel: Studenters arbeid med programmering i biovitenskapelige problemstillinger. En kvalitativ studie av biologistudenters arbeid med Python

      • Lenke til oppgaven: http://urn.nb.no/URN:NBN:no-73632

      • Fil: Masteroppgave_Håland.pdf

En kollegial holdning og praksis

Det digitale